| 追加時期 | |
| 詳細 | |
| 恵沢の平原：上空 | 第一章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「明命の直轄区：地上」が追加される | |
| 明命の直轄区：地上 | 恵沢の平原：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「痩躯の魔術師」が入手可能 | |
| 深淵なる大地：上空 | 第二章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「気炎の直轄区：地上」が追加される | |
| 気炎の直轄区：地上 | 深淵なる大地：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「結束の剣」が入手可能 | |
| 嘆きの水脈：上空 | 第四章八節クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「神水の直轄区：地上」が追加される | |
| 神水の直轄区：地上 | 嘆きの水脈：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「ハンチの槍」が入手可能 | |
| 無明の渓谷：上空 | 第六章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「宝光の直轄区：地上」が追加される | |
| 宝光の直轄区：地上 | 無明の渓谷：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「信義」が入手可能 | |
| 黄昏の丘：上空 | 第八章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「天時の直轄区：地上」が追加される | |
| 天時の直轄区：地上 | 黄昏の丘：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「霞切り」が入手可能 | |
| 聖地：上空 | 第九章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「女神の城：地上」が追加される | |
| 女神の城：地上 | 聖地：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「カイムの剣」と武器「戒めの塔」が入手可能 | |
| 大神殿中庭：地上（一回目） | 二周目の第三章二節クリア後 |
| 二周目第一章一節で取り損ねていた場合、宝箱から武器「囚われの女神」が入手可能 一度クリアするとミッション内容が変わる |
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| 大神殿中庭：地上（二回目） | 大神殿中庭：地上（一回目）クリア後 |
| 宝箱から武器「不死鳥の囀り」が入手可能 一度クリアするとミッション内容が変わる |
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| 大神殿中庭：地上（三回目） | 大神殿中庭：地上（二回目）クリア後 |
| 宝箱から武器「鷹羽根の槍」が入手可能 一度クリアするとミッション内容が変わる |
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| 大神殿中庭：地上（四回目） | 大神殿中庭：地上（三回目）クリア後 |
| 宝箱から武器「折れた鉄塊」が入手可能 一度クリアするとミッション内容が変わる |
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| 大神殿中庭：地上（五回目） | 大神殿中庭：地上（四回目）クリア後 |
| 宝箱から武器「魔印の銅剣」が入手可能 クリアすると内容が大神殿中庭（一回目）に戻る |
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| 閉じられた地：地上 | 二周目の第三章クリア後 |
| 宝箱から武器「月下の麗人」が入手可能 | |
| 炎洞塁：地上 | 二周目の第四章クリア後 |
| 宝箱から武器「ザンポの斧」が入手可能 | |
| 錆の町：地上 | 二周目の第五章クリア後 |
| 宝箱から武器「盗賊の極意」が入手可能 | |
| 光城郭：地上 | 二周目の第五章クリア後 |
| 宝箱から武器「ヤハの杖」が入手可能 | |
| 天時塔：地上 | 二周目の第八章クリア後 |
| 宝箱から武器「深い闇」が入手可能 | |
| 大神殿：地上 | 三周目の第十章クリア後 |
| 宝箱から武器「勇者のナイフ」が入手可能 | |
| 古の墓標：上空 | 三周目の第十一章クリア後 |
| クリアするとフリーミッション「古の墓標内部：上空」と「赤い記憶：地上」が追加される | |
| 古の墓標内部：上空 | 古の墓標：上空クリア後 |
| 武器「斉天の赤杖」が入手可能 | |
| 赤い記憶：地上 | 古の墓標：上空クリア後 |
| 宝箱から武器「月光と闇」が入手可能 |